Звучи, эуфониум! Добро пожаловать в клуб духового оркестра старшей школы Китауджи
Юу и Харука - давние подруги, которые всегда проводят время вместе. После поступления в старшую школу их рассаживают за разные парты. Чтобы сохранить привычную близость, девушки предпринимают нестандартные действия. В результате появляется Сакура, существо, ответственное за сохранение целостности временного потока. Её задача - защищать мир от сил, стремящихся изменить ход истории.
Первое задание Сакуры связано с поимкой вора Сугинами, появившегося в эпоху Эдо. Вору помогают скрыться две волшебницы, Немо и Михару, хотя украденный артефакт удается вернуть. Центр сохранения исторических событий, в котором состоит Сакура, должен определить дальнейшие действия. Мотивы вора и природа его помощниц остаются неясными. Эти события оказывают непосредственное влияние на отношения Юу и Харуки, ставя под вопрос будущее их дружбы.